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DNase I是什么?簡單來說,DNase I(DNA酶I),是核酸內切酶,專職“拆解”DNA分子。它屬于脫氧核糖核酸酶家族,主要作用是水解DNA的磷酸二酯鍵,將長鏈DNA切割成短小的寡核苷酸片段。這些片段通常帶有5′-磷酸基團,便于后續實驗或生物過程的進行。DNase I可用于一系列分子生物學應用,包括RNA提取、建庫、逆轉錄,以及RT-qPCR、體外轉錄等實驗,本篇將帶大家認識下這款酶~
DNase I可消化單鏈或雙鏈DNA,通常來源于牛胰腺。其原理是通過水解磷酸二酯鍵生成含?5′-磷酸基團和?3′-OH基團的單脫氧核苷酸/寡核苷酸片段。它的作用機制涉及兩個主要步驟:(1)與底物進行非特異性結合。(2)進行水解反應。

圖.DNase I作用原理圖
DNase I的活性依賴于鈣離子,并能被鎂離子或二價錳離子激活。鎂離子存在條件下,DNase I可隨機剪切雙鏈DNA的任意位點;二價錳離子存在條件下,DNase I可在同一位點剪切DNA雙鏈,形成平末端,或1-2個核苷酸突出的粘性末端。

圖.DNase I在不同離子環境下對底物的切割
傳統上,DNase I主要從牛胰腺中提取,即“牛源DNase I”。牛胰腺富含這種酶,因為它在動物消化系統中幫助分解攝入的DNA。但隨著生物技術的進步,研究人員通過基因工程在細菌(如大腸桿菌)或酵母中表達人源或牛源序列,生產出“重組DNase I”(rDNase I)。相比較牛胰腺提取的DNase I來說,重組DNase I避免了動物源風險,在純度、活性、穩定性、安全性等多方面更勝一籌。
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1.RNA樣品處理與qPCR體系去除DNA殘留
RNA制備過程中常常混入基因組DNA,這會影響下游轉錄組測序或實時定量PCR的準確性。DNase I是清除RNA制備體系中DNA污染的“標準工具”,通過短時孵育即可降解污染DNA,而對RNA無影響。
2.DNase I足跡分析
利用DNase I在自由DNA上隨機切割,而在蛋白質結合區域無法切割的特性,通過在電泳自顯影圖中觀察蛋白“保護區”產生的酶切缺失帶(Footprint),從而精確定位DNA—蛋白質結合位點。
3.體外轉錄去除模板DNA
體外轉錄(IVT)主要是以DNA為模板,加上對應的底物和緩沖液通過體外轉錄得到RNA。在體外轉錄實驗中,合成后的RNA可能會有DNA殘留,消除DNA殘留可以減少下游純化難度并增加產品的純度。
4.缺口平移法進行DNA標記
缺口平移法,是實驗室最常用的一種脫氧核糖核酸探針標記法。該方法是DNase I與E.coli DNA Polymerase I的聯合作用實現的。
5.細胞分散輔助
在組織消化或原代細胞制備過程中,DNase I可水解細胞破裂釋放的黏稠DNA,減少細胞團聚,提升單細胞制備效率與細胞培養成功率。
6.TUNEL檢測對照
細胞凋亡TUNEL檢測中,可使用DNase I處理細胞或組織樣本,以人為制造DNA斷裂,作為陽性對照用于方法學驗證。
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本產品是通過重組DNA技術,在畢赤酵母(Pichia pastoris)??中高效表達的重組牛胰腺脫氧核糖核酸酶I(Recombinant Bovine DNase I,也稱重組DNA酶I(牛源))。該酶是一種核酸內切酶,能夠水解單鏈或雙鏈DNA中的磷酸二酯鍵,產生帶有5’-磷酸末端的單核苷酸或寡核苷酸混合物。與傳統的動物組織提取來源的DNase I相比,本產品具有純度極高、無動物源病原體污染、批次間穩定性好等突出優點。
產品特點

數據指標
無RNase殘留
分別將空白組、DNase l與底物RNA孵育,比較瓊脂糖凝膠電泳圖變化。結果顯示金普諾安DNase l無RNase殘留。

圖:RNase殘留檢測
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